马政寺由来久矣,相传始建于明初,为纪念朱元璋之妻马政娘娘放粮赈灾，而在此立寺奉祀。

马政寺原是道教宫观（娘娘殿）。马政寺原名马政庙历道教信徒集资兴建，合肥百姓因慕娘娘而名；相传元末战乱时马氏路过此地,见百姓疾苦,便拿出粮救济,自己却节衣缩食,马政寺就是后人为祭祀明太祖之妻马政娘娘而建，香火盛隆。据碑文记载，该寺建于明初,清时重建，时都三进，延以回廊，光以色墙，浮雕四壁，庙貌巍峨。庙会期间方圆数十里香客不计其数，鼎盛时达数万之众。此庙迄今已六百年之久。道教面向民间的重要表现是扩充各地居民习惯崇拜的神祉作为道教神祉。
经风雨沧桑，曾两度被毁；1938年日军进犯合肥时，被战火烧毁；“文化大革命”中被造反派摧毁。第一次毁坏后，由当地乡人和一些善男信女筹资建盖。马政寺地处肥东县众兴乡华光村距肥东25公里，众兴水库东南上游。